در این انیمیشن، مگامایند، ذهن برتر و نابغه‌ی شرور دنیا، با چالش جدیدی روبرو می‌شود: سندیکای نابودی، گروهی از شروران نوظهور که تهدیدی جدی برای مترو سیتی به شمار می‌روند. پس از سال‌ها تلاش برای نابودی مترومن، رقیب دیرینه و قهرمان شهر، مگامایند حالا خود را در موقعیت ناخواسته‌ای می‌بیند: باید از همان شهری که همیشه سعی در نابودی آن داشت، محافظت کند.
داستان با ظهور سندیکای نابودی آغاز می‌شود، که با قدرت‌ها و تکنولوژی‌های پیشرفته‌ی خود، به سرعت به یک تهدید بزرگ برای امنیت مترو سیتی تبدیل می‌شوند. مگامایند، که عادت دارد همیشه در کانون توجه باشد و نقشه‌های شرورانه‌اش را علیه مترومن پیاده کند، حالا مجبور است با تشکیل یک تیم جدید به مقابله بپردازد. در این ماجراجویی، مگامایند باید راهی برای شکست سندیکای نابودی پیدا کند، در حالی که با مفهوم قهرمان بودن و ارزش‌هایی مانند دوستی، اعتماد و فداکاری دست و پنجه نرم می‌کند. او می‌آموزد که گاهی اوقات، برای مبارزه با شر، باید از قدرت‌ها و استعدادهای خود به شیوه‌ای مثبت استفاده کرد. مگامایند در برابر اتحادیه نابودی یک داستان پر از هیجان، اکشن و لحظات آموزنده است که نشان می‌دهد حتی بزرگ‌ترین شروران هم می‌توانند تغییر کنند و برای خیر بزرگ‌تری مبارزه کنند.
گپ فیلم تماشای انیمیشن نینجا چهارخونه‌ای را به شما پیشنهاد می‌کند.